Большой Ишкуль - горный водоём хребта Ишкуль. Вода в озере чистая и прозрачная, минерализация ее составляет 150 мг/л, гидрохимический состав гидрокарбонатно-кальциевый. Кислородный режим благоприятный. Озеро расположено в южнотаёжном низкогорном ландшафте.

Водосбор озера сложен кристаллическими сланцами, перекрытыми и поверхности продуктами физического выветривания — песчаными суглинками с обломками коренных пород, залесен, преобладают сосновые леса с примесью березы и разнотравно-вейникового травостоя. Богатство природы, красота гор и озер с давних лет влекли сюда людей. Объем водной массы составляет почти 20 млн.м3.

Озеро Ишкуль (в переводе «много озер») — одно из живописных озер Ильменского заповедника. Крутые склоны берегов Ишкуль — скалистые, а пологие заболочены и покрыты обильной растительностью. Сквозь прозрачную воду просматривается неровное дно, на котором выступают многочисленные скальные поднятия.

Форма озера продолговатая. Длина озера 3, 9 км, средняя ширина 0, 7 км. Площадь зеркала 2, 56 км2. Максимальная глубина превышает 14 м, средняя 7, 4 м. Абсолютная отметка уреза воды озера 322 м. Сжатое невысокими горами, озеро дважды изгибается почти под прямым углом. Изрезанные заливами берега создают впечатление группы небольших озер и оправдывают название «много озер».